[gmx-users] Gromacs under Windows

[Anton Feenstra]

Cornel, J. wrote:

> hoi Anton,
> 
> onderaan de aki.top file staan inderdaad die regels die je noemt. 
> En ik ben er zeker van dat cpp in
> 
> 
>>cpp		= C:\Gromacs\bin\cpp	; Preprocessor
> 
> 
> Staat. Echter als ik grompp run met -pp ipv -p dan krijg ik:
> 
> Fatal error. topol.top  does not exist,
> 
>  en dit betekent neem ik aan dat ie aki.top niet kan vinden, waar kan dit aan liggen??

No, -pp not in stead of -p, but in addition to, like:
grompp -p aki.top -pp
-pp is een output option.

-- 
Groetjes,

Anton
  _____________ _______________________________________________________
|             |                                                       |
|  _   _  ___,| K. Anton Feenstra                                     |
| / \ / \'| | | Dept. of Pharmacochem. - Vrije Universiteit Amsterdam |
|(   |   )| | | De Boelelaan 1083 - 1081 HV Amsterdam - Netherlands   |
| \_/ \_/ | | | Tel: +31 20 44 47608 - Fax: +31 20 44 47610           |
|             | Feenstra at chem.vu.nl - www.chem.vu.nl/~feenstra/       |
|             | "If You See Me Getting High, Knock Me Down"           |
|             | (Red Hot Chili Peppers)                               |
|_____________|_______________________________________________________|