[gmx-users] GROMACS with MPICH on Sun Cluster

[Alok]

Hi,

  I am trying to run GROMACS in parallel on a SUN Cluster with MPICH. I 
had installed FFTW 2.1.5 and Gromacs 3.2.1 without any error massage, 
but when i tried to use mdrun_mpi (or even mdrun_mpi -h) I got the 
following error message.


########################################################################################

[0] MPI Abort by user Aborting program !

[0] Aborting program!

p0_1870:  p4_error: : 0

########################################################################################

I followed the follwing procedure for installing FFTW 2.1.5 and GROMACS 
3.2.1.

First of all I set the PATH for MPICH  files in my .profile file.
PATH=/opt/mpichdefault-1.2.6/bin:$PATH
PATH=/opt/mpichdefault-1.2.6/lib:$PATH
PATH=/opt/mpichdefault-1.2.6/include:$PATH

########################################### FFTW 2.1.5 
#########################################
export MPICC=mpicc

export LIBS="-lmpich -lfmpich -lpmpich"

export MPILIBS="-L/opt/mpichdefault-1.2.6/lib"

export CPPFLAGS="-I/opt/mpichdefault-1.2.6/include"

export LDFLAGS="-L/opt/mpichdefault-1.2.6/lib"

./configure --enable-float 
--prefix=/users/bsbe/phd/alokjain/install/fftw --enable-mpi
make
make install

#################################################################################################




########################################## GROMACS 3.2.1 
########################################

export LDFLAGS="-L/opt/mpichdefault-1.2.6/lib 
-L/users/bsbe/phd/alokjain/install/fftw/lib"

export CPPFLAGS="-I/opt/mpichdefault-1.2.6/include 
-I/users/bsbe/phd/alokjain/install/fftw/include"

./configure --enable-mpi 
--prefix=/users/bsbe/phd/alokjain/install/gromacs --program-suffix=_mpi
make

make install

#################################################################################################



Any ideas regarding what is going wrong?

Please let me know if you need more information...

Thank you very much in advance,

regards,
Alok jain