[gmx-users] Re: PARADOCS

[Bjoern Olausson]

On Tuesday 03 June 2008 11:45:15 Rene Meier wrote:
> hollo björn,
>
> ich habs mal angeworfen. BECP-mini.mol2 ist kaputt. schaus dir mal in
> sybyl an. das kann ich nicht docken.
> als center für die active site habe ich x="-15" y="-7" z="4" gewählt.
> schau mal ob das ungefähr richtig ist.
>
> grüsse rene
>

Hey, danke!

BECP-mini.mol2 ist anscheinend nur mal wieder für SYBYL defekt... hier als PDB 
file. Das sollte funzen (denn grad das wäre interessant).


Das mit den Koordinaten kommt hin. Ich nehme immer Cys164 als center
Das S vom Cys liegt auf:
x: -14.165000
y: -4.394000
z: 4.358000

Hätt ich dir ja gleich schreiben koennen... aber du liegst ja verdannt nah 
dran.

Bin auf die Ergebnisse gespannt


-- 
Bjoern Olausson
Martin-Luther-University Halle-Wittenberg
Institute of Biochemistry/Biotechnology
AG Molecular Modeling
06099 Halle, Germany
Phone: +49-345-5524863
Fax: +49-345-5527011
-------------- next part --------------
A non-text attachment was scrubbed...
Name: BECP_mini.pdb
Type: text/pdb
Size: 7500 bytes
Desc: not available
URL: <http://maillist.sys.kth.se/pipermail/gromacs.org_gmx-users/attachments/20080603/890cc160/attachment.bin>