<HTML><HEAD><TITLE>Mail</TITLE>
<META content="KsDHTMLEDLib.ocx, FreeWare HTML Editor 1.159.7, ?Kurt Senfer" 
name=GENERATOR>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=GB2312"></HEAD>
<BODY style="FONT-SIZE: 9pt; FONT-FAMILY: " leftMargin=5 topMargin=5>
<DIV><%--AID_SENDTO_BEGIN--%>gmx-users<%--AID_SENDTO_END--%> 
<DIV>hello everyone:</DIV>
<DIV>i used the pull code in gromacs-3.2.1 to pull the dickerson DNA, use 
ffamber94 force field.&nbsp;</DIV>
<DIV>i fixed six carbon atoms in one end(3 on each chain ), and pull six in the 
other end of DNA.</DIV>
<DIV>The velocity is 0.0004nm/ps. The k is 10000&nbsp;kJ/(mol.nm.nm).i simulate 
3ns.</DIV>
<DIV>The DNA is stretched, but it isn't unzip.why ?</DIV>
<DIV>thanks alot in advance.&nbsp;</DIV><%--AID_EDIT_ATTACHMENT_BEGIN--%><BR><%--AID_EDIT_ATTACHMENT_END--%></DIV>
<DIV><%--AID_FROMNAME_BEGIN--%>qwp<%--AID_FROMNAME_END--%><A 
href="mailto:<%--AID_FROMADDRESS_BEGIN--%>qi-wenpeng@mail.sdu.edu.cn<%--AID_FROMADDRESS_END--%>"><%--AID_FROMADDRESS_BEGIN--%>qi-wenpeng@mail.sdu.edu.cn<%--AID_FROMADDRESS_END--%></A></DIV>
<DIV>2005-9-2 </DIV></BODY></HTML>