<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=gb2312">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1522" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>Hi</FONT><FONT face=Բ color=#008000>every 
one!</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>I've install the GM without parrel in 
/home/gromacs_s that have&nbsp;been linked.&nbsp;So i can run it with "mdrun" 
directly.&nbsp;But when i use&nbsp;PBS the errors happened.My pbs script is as 
follows.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>#!/bin/sh<BR>###Job name<BR>#PBS -N 
test</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>### Output files<BR>#PBS -o test.out<BR>#PBS -e 
test.err</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>### Queue name<BR>#PBS -q workq</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>### CPU number<BR>#PBS -l nodes=1:ppn=1<BR>#JRS 
-l walltime=2400:00:00</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>### Script Commands<BR>cd 
$PBS_O_WORKDIR</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>mdrun<BR>exit 0</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>But some error happened that is :</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>mdrun: error while loading shared libraries: 
libXm.so.3: cannot open shared object file: No such file or 
directory</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>how can i fix it !</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000>thanks all!</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Բ color=#008000></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV><FONT face=Բ color=#008000>
<DIV><BR>ף </DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>*************************************************<BR>Ji 
Qingࣩ<BR>Institute of Chemistry, Chinese Academy of 
Sciences<BR>пԺѧ<BR>Tel: 0086-10-62562894&nbsp; 
82618423<BR>*************************************************</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV></FONT>&nbsp;</DIV></BODY></HTML>