How did you compile Gromacs? Did you use the &quot;--with-qmmm-cpmd&quot; flag?<br><br><div class="gmail_quote">On Feb 6, 2008 6:35 PM,  &lt;<a href="mailto:jacopo.sgrignani@unifi.it">jacopo.sgrignani@unifi.it</a>&gt; wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi<br>I tried to use the cpmd-gmx interface with &nbsp;the files in the<br>qmmm-examples folder. &nbsp;I&#39;m able to run grompp but when i Try to run<br>
mdrun i can get this message: CPMD calcualtion only supported with<br>CPMD.<br>I tested the two programs indipendently and they seem to work fine.<br>I put all the requested files &nbsp;in the folder &nbsp;a .gro file, .top,<br>CPMD_inp.tmpl and pseudopotentials.<br>
<br><br>I used this input file:<br><br>title &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;2h2o<br>cpp &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;/usr/bin/cpp<br>constraints &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;none<br>integrator &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;l-bfgs<br>;integrator &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;steep<br>dt &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;0.002 &nbsp; &nbsp;; ps !<br>
nsteps &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;1000<br>nstlist &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;0<br>ns_type &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;simple<br>pbc &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;no<br>rlist &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;0.0<br>rcoulomb &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;0.0<br>rvdw &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;0.0<br>coulombtype &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;cut-off<br>
QMMM &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;yes<br>QMmethod &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;CPMD<br>QMMMscheme &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;normal<br>QMMM-grps &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;QM<br>QMbasis &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;STO-3G<br>planewavecutoff &nbsp; &nbsp; = &nbsp;90<br>qmmmcoul_cutoff &nbsp; &nbsp; = &nbsp;40<br>qmbox_cpmd &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;18.0 18.0 18.0<br>
;<br>; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Energy minimizing stuff<br>;<br>emtol &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = &nbsp;3.0<br>emstep &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;= &nbsp;0.01<br><br><br>Can anybody help me?<br>Thanks Jacopo<br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>
</blockquote></div><br>