<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><P>Hello,</P><P></P><P>thank you very much for the comprehensive guide. It was quite straighforward, better than others I have come accross. The problem is that I do not still understand which will be the components of the equation from the tools that gromacs provides.¬†<BR></P><P></P><P>From what I have read I have to use the middle value of the difference of :</P><P>the potential energy of the mother chains and the whole potential energy of the box of the simulation.</P><P></P><P>Could you sed a little bit more light to this?</P><P></P><P>Thank you, Nikos¬†</P><BR>--- David van der Spoel <I>&lt;spoel@xray.bmc.uu.se&gt;</I> schrieb am <B>Di, 2.12.2008:<BR><BLOCKQUOTE style="border-left: 2px solid rgb(16, 16, 255); margin-left: 5px; padding-left: 5px;">Von: David van der Spoel &lt;spoel@xray.bmc.uu.se&gt;<BR>Betreff: Re: [gmx-users] Hildebrand's solubility
 parameter<BR>An: "Discussion list for GROMACS users" &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;<BR>Datum: Dienstag, 2. Dezember 2008, 16:48<BR><BR><PRE>Claus Valka wrote:
&gt; Hello,
&gt; 
&gt; could you tell me if it is possible with gromacs to calculate the
Hildebrand's solubility parameter? 
Yes, but you have to derive the components in the equation yourself using
g_energy.

http://cool-palimpsest.stanford.edu/byauth/burke/solpar/solpar2.html

&gt; Thank you,
&gt; Nikos
&gt; 
&gt; 
&gt; 
&gt; 
&gt; ------------------------------------------------------------------------
&gt; 
&gt; _______________________________________________
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&gt; Please search the archive at http://www.gromacs.org/search before posting!
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-- David van der Spoel, Ph.D., Professor of Biology
Molec. Biophys. group, Dept. of Cell &amp; Molec. Biol., Uppsala University.
Box 596, 75124 Uppsala, Sweden. Phone:        +46184714205. Fax: +4618511755.
spoel@xray.bmc.uu.se        spoel@gromacs.org   http://folding.bmc.uu.se
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</PRE></BLOCKQUOTE></td></tr></table><br>