But I don't think it is pre-equilibrium POPC membrane...... and more over, the position from VMD is not pre-aligned with OPM database. It would be a great problem for putting our protein in the membrane......<div><br></div><div><br></div><div><br><div></div><br>At 2011-05-30úČ"Sergio&nbsp;Manzetti"&nbsp;&lt;sergio.manzetti@vestforsk.no&gt; wrote:<br> <blockquote id="isReplyContent" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">You can build it using VMD (VIsual Molecular Dynamics)<br><br><br><br><div class="gmail_quote">2011/5/30 albert <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:leuven@yeah.net">leuven@yeah.net</a>&gt;</span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
Dear all:<br><br>&nbsp; I would like to use charmm36 and POPC for membrane protein simulation. and I am wondering where can I download charmm36 pre-pribriumed POPC PDB and topol file for gromacs?<br><br>Thank you very much<br>
Best<br><br>--<br>
gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br>
</blockquote></div>