<html><head></head><body><div style="font-family: Verdana;font-size: 12.0px;"><div>
<div>I ran into this, you basically should determine your time frame, and install 4.5.4 if its a problem local (only 1-2 hours), to finish the work, otherwise you need to start from scratch.&nbsp; But I did this with older versions, so do not know about higher versions (such as if the&nbsp;programmers&nbsp;eliminated the read version number thing at many of the script initializing things...).&nbsp; The auxillary software does work for analysis, but you end up having to cut things into portions with some aspects, 1/2 one version versus 1/2 the other...but mostly for higher end analysis, not the simplistic ones, such as distance versus hessian matrices or covariance.</div>

<div>&nbsp;</div>

<div>Stephan Watkins</div>

<div>&nbsp;
<div name="quote" style="margin: 10px 5px 5px 10px; padding: 10px 0px 10px 10px; border-left-color: rgb(195, 217, 229); border-left-width: 2px; border-left-style: solid; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div style="margin: 0px 0px 10px;"><b>Gesendet:</b>&nbsp;Mittwoch, 23. Oktober 2013 um 16:17 Uhr<br/>
<b>Von:</b>&nbsp;&quot;Kevin Chen&quot; &lt;fch6699@gmail.com&gt;<br/>
<b>An:</b>&nbsp;&quot;&#39;Discussion list for GROMACS users&#39;&quot; &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;<br/>
<b>Betreff:</b>&nbsp;RE: [gmx-users] Continuing runs from 4.5.4 in 4.6.3</div>

<div name="quoted-content">There shouldn&#39;t be a problem for that. BTW, can you also enter a ticket at<br/>
Daigrid.org for this matter?<br/>
<br/>
Thanks<br/>
<br/>
-Kevin<br/>
<br/>
<br/>
-----Original Message-----<br/>
From: gmx-users-bounces@gromacs.org [mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org]<br/>
On Behalf Of rajat desikan<br/>
Sent: Wednesday, October 23, 2013 1:24 AM<br/>
To: Discussion list for GROMACS users<br/>
Subject: [gmx-users] Continuing runs from 4.5.4 in 4.6.3<br/>
<br/>
Hi,<br/>
<br/>
We recently had a software upgrade in our cluster from gromacs 4.5.4. to<br/>
gromacs 4.6.3.. I need to continue an earlier simulation that had been run<br/>
in 4.5.4. using the .cpt, .tpr and .mdp.<br/>
<br/>
Are there any issues with continuing these runs in 4.6.3.? Can I concatenate<br/>
these trajectories for later analysis?<br/>
<br/>
I notice that I cannot use a 4.6.3 .cpt and .tpr in 4.5.4.<br/>
<br/>
Any input will be appreciated. Thanks.<br/>
<br/>
--<br/>
Rajat Desikan (Ph.D Scholar)<br/>
Prof. K. Ganapathy Ayappa&#39;s Lab (no 13), Dept. of Chemical Engineering,<br/>
Indian Institute of Science, Bangalore<br/>
--<br/>
gmx-users mailing list gmx-users@gromacs.org<br/>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br/>
* Please search the archive at<br/>
<a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br/>
* Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www<br/>
interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br/>
* Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br/>
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gmx-users mailing list gmx-users@gromacs.org<br/>
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www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br/>
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</div></div></body></html>