[gmx-developers] gmx_d nmeig command Not enough memory

Adrien Nicolaï adrien.nicolai at u-bourgogne.fr
Tue Jul 5 14:48:18 CEST 2016


All right!

Thank you for your help

Best,

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Adrien Nicolaï / Maître de conférences
Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne, UMR 6303 CNRS
Département NANO - Equipe Physique appliquée aux protéines
Université de Bourgogne Franche-Comté / Faculté des Sciences et Techniques Mirande
9, Av. Savary - B.P. 47 870 21078. DIJON CEDEX - France
Email : adrien.nicolai at u-bourgogne.fr <mailto:adrien.nicolai at u-bourgogne.fr>
Tél: 03 80 39 60 93
URL : https://icb.u-bourgogne.fr/fr/axes-scientifiques/nano/physique-appliquee-aux-proteines.html <https://icb.u-bourgogne.fr/fr/axes-scientifiques/nano/physique-appliquee-aux-proteines.html>
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> On 05 Jul 2016, at 14:46, Berk Hess <hess at kth.se> wrote:
> 
> Supporting more than 2^31 total eigenvector elements requires code changes through all our matrix and I/O routines. I don't think this is worth the effort with the current diagonalization times. If we add OpenMP parallelization, we can reconsider doing this.

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