[gmx-users] Sanjay (Reg: grompp error)

sanjay choubey sanjay_chby at yahoo.com
Thu May 14 08:30:58 CEST 2015


hi, i am doing membrane simulation . While emedding protein using the command given below:

                                          grompp -f empty.mdp -c prot_mem.nowater.gro -p topol.top -o test.tpr  
                                                                                   I  am getting the error:
Fatal error:Atomtype CA not found

                                                             i checked topology file as well as lipid.itp file CA is there.
                                                                                                                           kindly suggest the solution.


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