[gmx-users] how to keep the ligand inside water box

Rahma Dahmani rahma.dahmani at fst.utm.tn
Wed Nov 14 13:08:38 CET 2018


Hi GMX users,

After running nvt equilibration, my ligand get out the box and before
proceeding to npt equilibration i want to know how to get (and keep if is
it possible) the ligand in water box* center* ?

Thank you !

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*Rahma Dahmani Doctorante en CHIMIE Unité de Recherche: Physico-Chimie des
Matériaux à l'état condensé, Laboratoire de Chimie Théorique et
Spectroscopie MoléculaireUniversité de Tunis El Manar, Faculté des Sciences
de Tunis Campus Universitaire Farhat Hached - BP n ° 94 - Rommana 1068,
Tunisie Tél: (+216) 28151042*


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